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Python3 のインストール |
[Mac, Win]
以下のウェブサイトを開いて、 "Release version list" をクリックしてください。 https://www.python.org/downloads/ |
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スクロールダウンして、ご自身の PC にあったインストーラーを選んでください。 |
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[Mac]
ダウンロードして得られた python-3.7.4-macosx10.9.pkg ファイルをダブルクリックし、Python3 をインストールします。
[Win]
32 bit バージョンの Windows は、以下を選んでください。
Windows x86 web-based installer.
64 bit バージョンはこちらです。
Windows x86-64 web-based installer.
どちらのバージョンかわからない場合は、以下を参照してください: https://support.microsoft.com/ja-jp/help/958406) |
その後、以下の様にパッケージをインストールしてください。 |
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[Mac]
ターミナルは、以下にあります。
Applications > Utilities> Terminal.app
[Win]
Windows では、Cygwinを使います。Cygwin は以下を参照してインストールしてください。 |
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Command prompt を利用しても良いです:
Program > Accessory > Command prompt
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[Mac, Win]
Python3 がインストールできたか、確認しましょう。
[inouejun:examples]$ which python3
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/bin/python3
[inouejun:examples]$ which python
/usr/bin/python
[inouejun:examples]$ python -V
Python 3.7.4
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テキストエディタ
プログラミングでは、テキストエディタは非常に重要です。"find and replace"を使うことで、無用なプログラミングを避けることができます。
[Mac, Win]
BBEdit (https://www.barebones.com/products/bbedit/). Free Download をクリックしてください。BBEdit の使い方は、こちら をご覧ください。
[Win]
Notepad++ をご利用ください。
[Mac, Win]
テキストファイルを保存するときは、改行コードを Unix にしてください。
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BBEdit
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Notepad++
Edit > EOL Conversion
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hello_world.py |
ターミナルから、hello_world.py を走らせます。
cd を使って、以下のディレクトリに入ります。
$ cd xxxx/exercises and examples/printing_text/examples
以下のプログラムを使います。
hello_world.py
上記のコマンドで、下線部分は以下の手順で入力できます。 |
[Mac, Cygwin] |
examples ディレクトリをドラッグ&ドロップします。 |
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[Command prompt] |
アドレスをコピー&ペーストします。 |

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[Mac, Win]
ターミナルで printing_text/examples ディレクトリに入れたか確認します。 pwd タイプします。
[inouejunmp:examples]$ pwd
/Users/inouejunmp/Downloads/exercises and examples/printing_text/examples
lsコマンドで、ディレクトリに入っているファイルを表示できます。
[inouejun:examples]$ ls
comment.py print_length.py
....
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[Mac, Win]
エディタで hello_world.py を開きます。 |
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以下のコマンドを入力します。
$ python3 hello_world.py
すると、以下の文章が返ってきます。
Hello world
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以下のコマンドで pdf ファイルが作成されるはずです。
python3 plot_python.py
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このスクリプトは、T. Sato さんから教えていただきました。ありがとうございます。(2020 年 10 月)
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matplotlib と Cartopy をインストールする必要があります。plot_latlon.tar.gz を動かすために必要なパッケージをインストールします。
Mac へのインストール
Mac には割とスムーズにインストールできました。日々適当を参考にしました。
git clone https://github.com/OSGeo/proj.4.git
cd proj.4/
git checkout -b 4.9.0 tags/4.9.0
./configure
make
make install
brew install geos
pip3 install shapely cartopy --no-binary shapely --no-binary cartopy
pip3 install matplotlib
pip3 install scipy
pip3 install pandas
すると、
ImportError: NumPy 1.10+ is required to install cartopy.
というメッセージが長文の間に出ましたが、numpy がなくても plot_latlon.py は動きました。
python3 plot_latlon.py
pip3 install xlrd==1.2.0
pip3 install openpyxl
python3 plot_latlon.py
以上で、plot_latlon.py が動きました。
Linux へのインストール
Linux (CentOS 7) へのインストールは、色々試してやっとできました (2021/3/1)。日々適当、JURI*GIS、jupyter-notebook で〜によると。Cartpy を入れるには、geos と proj.4 が必要です。pip install するときに -no-binary が必要です。
実際に以下の例題にある plot_latlon.py を走らせると、以下のようなエラーが出ました。
[pre jinoue:plot_latlon]$ python3 plot_latlon.py
python3: geos_ts_c.cpp:3612: int GEOSCoordSeq_getSize_r(GEOSContextHandle_t, const geos::geom::CoordinateSequence*, unsigned int*): Assertion `0 != cs' failed.
中止 (コアダンプ)
こちらの記事が参考になると思います。 以下のような操作を行うように支持されています。
pip uninstall cartopy pip uninstall shapely
pip install shapely cartopy --no-binary shapely --no-binary cartop
解決は一筋縄では行かないと思います。私の場合は geos のバージョンに問題があったようです。http://download.osgeo.org/geos/ をブラウザで開くと様々なバージョンがあるので、いくつか wget でダウンロードして試していくうちに、3.8.1 で上記のエラーが出ずに動くようになりました。Arial がない、と言うエラーが新たに出ましたが、plot_latlon.py が動いてアウトプット (pdf ファイル) は無事に得られました)。
wget wget http://download.osgeo.org/geos/geos-3.8.1.tar.bz2
tar -jxvf geos-3.8.1.tar.bz2
cd geos-3.8.1/
./configure
make
sudo make install
pip3 install shapely cartopy --no-binary shapely --no-binary cartopy
[pre jinoue:plot_latlon]$ python3 plot_latlon.py
findfont: Font family ['Arial'] not found. Falling back to DejaVu Sans.
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Orthographic |
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以下のコマンドで pdf ファイルが作成されるはずです。
python3 orthographic.py
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緯度経度を用いたプロット |
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python3 plot_latlon.py
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plot_latlon.tar.gz
このスクリプトは、T. Sato さんから教えていただきました。(2020 年 10 月)
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CTD data から緯度経度、温度、塩分データを抽出 |
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cross-section_python.tar.gz |
PDF ファイルが作成されるまで、1 分弱かかります。
このスクリプトは、T. Sato さんから教えていただきました。(2020 年 10 月)
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dataset-duacs-nrt-global-merged-allsat-phy-1oct.nc は copernicus から入手できるそうです。このスクリプトは、T. Sato さんの作品です。(2020 年 10 月)
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List filesファイルをリストする
[Mac]
ls コマンド。
$ ls
coding_dna.txt sequences.fasta
genomic_dna.py writing_a_fasta_file.py
[Win]
dir コマンド.。
$ dir
上の階層に移動
$ cd ..
カレントディレクトリのパスを表示
$ pwd
xxxx/exercises and examples/reading_files/exercises
[Mac]
エディターでファイルを開く
$ open genomic_dna.py
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matplotlib
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